כמו כן, הרמטכ״ל אייל זמיר יקים בתוך שבעה ימים ועדה צבאית מיוחדת בראשות קצין בדרגת אלוף-משנה ושני קצינים בדרגת סגן-אלוף, שתבחן באופן פרטני בקשות להקפאת הליכים שיגישו תלמידי הישיבות בתוך 30 יום.
כל עוד עניינו של המלש"ב מתברר בוועדה, לא ניתן יהיה להעמידו לדין, הליכים משפטיים קיימים יופסקו, ואף יוקפא ביצועם של פסקי דין חלוטים. כדי להיות זכאי להסדר, על המלש"ב ללמוד באופן סדיר לפחות 45 שעות שבועיות בישיבה (או 40 שעות בכולל), ללא כל עיסוק נוסף, ולספק תצהיר שלו ושל ראש הישיבה.
לצד הקפאת המעצרים, החוק מהדק את הפיקוח ומחייב מפקחים לבצע ביקורת נוכחות בישיבות אחת לשלושה חודשים. ישיבה שבה תתגלה אי-נוכחות חוזרת של 20% ומעלה מתלמידיה, תקבל התראה, ואם המצב יימשך – היא תוסר מרשימת המוסדות המוכרים ותלמידיה יאל
